W czasach zawieruchy wojennej Po powrocie do Polski Kisielewski został zatrudniony jako redaktor w Polskim Radiu, jednak ta współpraca nie potrwała długo z powodu nadciągającej wojennej katastrofy. Na 6 września 1939 zaplanowane było prawykonanie jego I Symfonii w Filharmonii Narodowej, dyrygować miał Grzegorz Fitelberg. Niestety wojna rozpoczęła się już 1 września, więc koncert się nie odbył, a sama partytura też gdzieś zginęła w zniszczonej Warszawie. Kisielewski uczestniczył w kampanii wrześniowej 1939. Okupację spędził w Warszawie, pracując jako pianista i nauczyciel muzyki oraz współdziałając z Wydziałem Kultury i Propagandy Delegatury Rządu RP na Kraj. Natomiast zawierucha wojenna nie przeszkodziła mu w zawarciu małżeństwa z Lidią Hintz, również w czasie okupacji narodził się ich pierwszy syn – Wacek. W tym czasie Kisiel rozpoczął też działalność konspiracyjną, między innymi w podziemnym radiu. Namówiony przez Czesława Miłosza zaczął też pisać swo...